Après avoir suivi des cours d'art dramatique, il joue, dès 1966, aux côtés de Patrice Chéreau, entamant une longue carrière au théâtre, passant des planches du TNP dirigé par Georges Wilson à une trentaine de pièces mises en scène, entre autres, par Jérôme Savary ou Claudia Stavisky.
Jean-Pierre Bagot vivait depuis une trentaine d'années à Bitry, dans la Nièvre, où il était conseiller municipal et animait des ateliers de théâtre. Il revenait régulièrement à Plénée-Jugon où il possédait une maison familiale.